Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NKX1-1Q15270 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NKX1-1Q15270 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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