Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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