Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NID2Q14112 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NID2Q14112 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NID2Q14112 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NID2Q14112 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NID2Q14112 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NID2Q14112 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NID2Q14112 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NID2Q14112 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NID2Q14112 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NID2Q14112 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NID2Q14112 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NID2Q14112 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NID2Q14112 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NID2Q14112 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NID2Q14112 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NID2Q14112 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NID2Q14112 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NID2Q14112 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NID2Q14112 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms