Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A6Q14031 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A6Q14031 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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