Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGB1Q14028 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CNGB1Q14028 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms