Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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