Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKP1Q13835 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP1Q13835 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
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