Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA4Q13772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA4Q13772 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA4Q13772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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