Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA7Q13683 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA7Q13683 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms