Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR3Q13615 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR3Q13615 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR3Q13615 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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