Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF4BQ13523 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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