Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF6Q13247 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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