Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-13■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-13■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.723e-13■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.535e-12■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.825e-12■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 525.17■■□□□ 1.624e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 322.4■■□□□ 1.184e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 322.25■■□□□ 1.154e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 517.22■□□□□ 0.352e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PECR-208ENST00000497889 824 ntTSL 514.78□□□□□ -0.042e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PECR-206ENST00000474093 585 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-10■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PECR-204ENST00000464722 640 ntTSL 46.11□□□□□ -1.432e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 RGS12-219ENST00000511805 552 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.582e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.827e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.568e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 517.07■□□□□ 0.328e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 516.11■□□□□ 0.178e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 58.08□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 27.18□□□□□ -1.268e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.368e-7■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.691e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-8■■■■□ 25.3
ILF3Q12906 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.114e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 AC105036.3-203ENST00000567875 652 ntTSL 213.48□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 AC105036.3-202ENST00000565138 674 ntTSL 313.48□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.284e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-211ENST00000463996 374 ntTSL 212.44□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 25.2
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ILF3Q12906 AC105036.3-204ENST00000568707 789 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 AC105036.3-201ENST00000566032 583 ntTSL 211.45□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-222ENST00000495381 3993 ntTSL 29.22□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 25.2
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ILF3Q12906 CCDC14-205ENST00000419247 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.82□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.654e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 24.43□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-215ENST00000479903 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 54□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.781e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.271e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 319.54■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 419.43■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 415.01□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 25.2
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ILF3Q12906 RAI14-207ENST00000505185 225 ntTSL 29.46□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 25.2
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ILF3Q12906 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 46.6□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 46.6□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-217ENST00000511652 470 ntTSL 36.03□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 45.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 45.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 45.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 44.89□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 RAI14-210ENST00000507502 340 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-209ENST00000497791 1691 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.163e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.43e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.43e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.43e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-203ENST00000462091 2001 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-205ENST00000474588 1789 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-206ENST00000479719 2340 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-202ENST00000460034 2081 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 UMPS-204ENST00000467167 2242 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.393e-12■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 NBPF1-206ENST00000599069 2752 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.314e-9■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 NBPF1-205ENST00000449853 2755 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.34e-9■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.414e-9■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.654e-9■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 NBPF1-202ENST00000420513 488 ntTSL 36.77□□□□□ -1.334e-9■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 ZNF609-203ENST00000558680 418 ntTSL 38.71□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 25.2
ILF3Q12906 CR1L-201ENST00000294997 1587 ntTSL 1 (best)7.25□□□□□ -1.257e-8■■■■□ 25.1
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