Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms