Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLEQ07864 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLEQ07864 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLEQ07864 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLEQ07864 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLEQ07864 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLEQ07864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLEQ07864 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLEQ07864 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLEQ07864 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLEQ07864 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLEQ07864 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLEQ07864 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLEQ07864 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLEQ07864 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLEQ07864 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLEQ07864 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLEQ07864 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLEQ07864 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms