Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELAQ04206 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELAQ04206 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELAQ04206 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELAQ04206 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELAQ04206 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELAQ04206 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELAQ04206 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELAQ04206 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELAQ04206 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELAQ04206 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELAQ04206 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELAQ04206 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELAQ04206 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELAQ04206 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.4 ms