Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01547P58512 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC01547P58512 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms