Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME5P56597 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME5P56597 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME5P56597 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME5P56597 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME5P56597 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME5P56597 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME5P56597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME5P56597 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME5P56597 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME5P56597 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME5P56597 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME5P56597 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME5P56597 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME5P56597 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME5P56597 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME5P56597 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms