Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF10P55107 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF10P55107 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF10P55107 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF10P55107 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF10P55107 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF10P55107 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF10P55107 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF10P55107 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms