Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC12A3P55017 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms