Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P54278 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P54278 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P54278 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P54278 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P54278 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P54278 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P54278 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P54278 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P54278 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P54278 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P54278 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P54278 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P54278 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P54278 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P54278 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PMS2P54278 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P54278 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P54278 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms