Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRISP3P54108 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms