Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOSBP53539 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOSBP53539 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOSBP53539 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOSBP53539 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOSBP53539 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOSBP53539 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOSBP53539 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOSBP53539 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOSBP53539 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOSBP53539 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOSBP53539 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOSBP53539 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOSBP53539 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOSBP53539 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOSBP53539 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOSBP53539 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOSBP53539 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOSBP53539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOSBP53539 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOSBP53539 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOSBP53539 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOSBP53539 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOSBP53539 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOSBP53539 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOSBP53539 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms