Protein–RNA interactions for Protein: P53259

PCP1, Rhomboid protein 1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCP1	P53259	YMD8	YML038C	1329 nt		4.63	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	CLP1	YOR250C	1338 nt		4.63	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	UBP7	YIL156W	3216 nt		4.63	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	NOT3	YIL038C	2511 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	MED2	YDL005C	1296 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YHP1	YDR451C	1062 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	PHM8	YER037W	966 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	NQM1	YGR043C	1002 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	NVJ1	YHR195W	966 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YHR214W	YHR214W	612 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	GAT4	YIR013C	366 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YKR104W	YKR104W	921 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	POM33	YLL023C	840 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YAR066W	YAR066W	612 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	RER2	YBR002C	861 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	DFG5	YMR238W	1377 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	VMA13	YPR036W	1437 nt		4.62	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	DPH2	YKL191W	1605 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SEM1	YDR363W-A	270 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YMR114C	YMR114C	1107 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	RPS19B	YNL302C	435 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	CWC27	YPL064C	906 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	ISA2	YPR067W	558 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	FES1	YBR101C	873 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YIL067C	YIL067C	2037 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	IBA57	YJR122W	1494 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	TNA1	YGR260W	1605 nt		4.61	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	CBP1	YJL209W	1965 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	MCM6	YGL201C	3054 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	EDC1	YGL222C	528 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	GRE3	YHR104W	984 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	PAU17	YLL025W	375 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	GEP5	YLR091W	882 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SPS18	YNL204C	903 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	LEM3	YNL323W	1245 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	OAZ1	YPL052W	879 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	HSP26	YBR072W	645 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	QDR1	YIL120W	1692 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SIS2	YKR072C	1689 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	KIP2	YPL155C	2121 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SKN1	YGR143W	2316 nt		4.6	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	MOB2	YFL034C-B	864 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	EPS1	YIL005W	2106 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YIL028W	YIL028W	399 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YJL068C	YJL068C	900 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	MET3	YJR010W	1536 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	ADD66	YKL206C	804 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YLR124W	YLR124W	345 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	POR1	YNL055C	852 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	RPL3	YOR063W	1164 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YPL062W	YPL062W	405 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	YPL073C	YPL073C	486 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	ERI1	YPL096C-A	207 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	SSO1	YPL232W	873 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	NRG2	YBR066C	663 nt		4.59	□□□□□ -1.67
PCP1	P53259	FAT3	YKL187C	2253 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	NDC1	YML031W	1968 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	SAC6	YDR129C	1929 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YDL183C	YDL183C	963 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	PNP1	YLR209C	936 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YLR283W	YLR283W	945 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	snR3	snR3	194 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	ABZ1	YNR033W	2364 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.58	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YAP1	YML007W	1953 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	VCX1	YDL128W	1236 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YDR053W	YDR053W	396 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	SUA5	YGL169W	1281 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YIL086C	YIL086C	309 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YKL223W	YKL223W	333 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YNL234W	YNL234W	1281 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	SCO1	YBR037C	888 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	ERG7	YHR072W	2196 nt		4.57	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	EIS1	YMR031C	2532 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	RIM101	YHL027W	1878 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	UBP9	YER098W	2265 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	PAF1	YBR279W	1338 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	ECM1	YAL059W	639 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YKR041W	YKR041W	753 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	YOL050C	YOL050C	321 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	IFM1	YOL023W	2031 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	RFA1	YAR007C	1866 nt		4.56	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	COQ6	YGR255C	1440 nt		4.55	□□□□□ -1.68
PCP1	P53259	THI21	YPL258C	1656 nt		4.55	□□□□□ -1.68

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