Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1BP51168 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms