Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRE11P49959 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRE11P49959 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRE11P49959 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRE11P49959 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRE11P49959 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRE11P49959 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRE11P49959 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRE11P49959 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRE11P49959 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRE11P49959 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRE11P49959 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRE11P49959 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRE11P49959 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRE11P49959 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRE11P49959 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRE11P49959 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRE11P49959 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRE11P49959 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms