Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1EP49674 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms