Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT5P48643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT5P48643 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT5P48643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT5P48643 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT5P48643 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT5P48643 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT5P48643 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT5P48643 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT5P48643 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT5P48643 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT5P48643 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT5P48643 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT5P48643 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT5P48643 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT5P48643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT5P48643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms