Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABIFP47224 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABIFP47224 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABIFP47224 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABIFP47224 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABIFP47224 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABIFP47224 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABIFP47224 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABIFP47224 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABIFP47224 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABIFP47224 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABIFP47224 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABIFP47224 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABIFP47224 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABIFP47224 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABIFP47224 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABIFP47224 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABIFP47224 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABIFP47224 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABIFP47224 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABIFP47224 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABIFP47224 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABIFP47224 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABIFP47224 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms