Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCAPD3P42695 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCAPD3P42695 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3P42695 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NCAPD3P42695 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms