Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA1P38398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRCA1P38398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA1P38398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms