Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT4P35916 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FLT4P35916 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT4P35916 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT4P35916 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT4P35916 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT4P35916 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT4P35916 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT4P35916 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT4P35916 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT4P35916 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT4P35916 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT4P35916 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT4P35916 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT4P35916 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT4P35916 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT4P35916 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT4P35916 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT4P35916 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT4P35916 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT4P35916 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FLT4P35916 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FLT4P35916 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FLT4P35916 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FLT4P35916 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FLT4P35916 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT4P35916 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FLT4P35916 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FLT4P35916 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FLT4P35916 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FLT4P35916 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FLT4P35916 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FLT4P35916 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FLT4P35916 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT4P35916 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT4P35916 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT4P35916 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT4P35916 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT4P35916 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT4P35916 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT4P35916 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT4P35916 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT4P35916 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT4P35916 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms