Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCKARP32238 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCKARP32238 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCKARP32238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCKARP32238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKARP32238 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKARP32238 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKARP32238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKARP32238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKARP32238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCKARP32238 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCKARP32238 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKARP32238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKARP32238 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKARP32238 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKARP32238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKARP32238 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKARP32238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKARP32238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms