Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CPS1P31327 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CPS1P31327 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CPS1P31327 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CPS1P31327 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CPS1P31327 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CPS1P31327 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CPS1P31327 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CPS1P31327 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CPS1P31327 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPS1P31327 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPS1P31327 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPS1P31327 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CPS1P31327 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CPS1P31327 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CPS1P31327 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CPS1P31327 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CPS1P31327 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPS1P31327 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPS1P31327 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPS1P31327 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPS1P31327 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPS1P31327 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPS1P31327 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CPS1P31327 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPS1P31327 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPS1P31327 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CPS1P31327 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPS1P31327 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPS1P31327 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPS1P31327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPS1P31327 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPS1P31327 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPS1P31327 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPS1P31327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms