Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms