Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms