Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCSK1P29120 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms