Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD1P28289 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms