Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA5P20719 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA5P20719 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms