Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6AP16499 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6AP16499 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6AP16499 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms