Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD44P16070 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD44P16070 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD44P16070 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD44P16070 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CD44P16070 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD44P16070 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD44P16070 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD44P16070 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD44P16070 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD44P16070 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD44P16070 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD44P16070 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD44P16070 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD44P16070 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD44P16070 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD44P16070 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD44P16070 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD44P16070 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD44P16070 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD44P16070 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms