Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF4P15884 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF4P15884 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF4P15884 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF4P15884 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF4P15884 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF4P15884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF4P15884 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF4P15884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF4P15884 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF4P15884 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF4P15884 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF4P15884 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF4P15884 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF4P15884 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCF4P15884 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF4P15884 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF4P15884 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF4P15884 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF4P15884 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms