Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC130P13994 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms