Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-EP13747 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms