Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC172P0C7W6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms