Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRR29P0C7W0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR29P0C7W0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms