Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFIT1P09914 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIT1P09914 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT1P09914 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms