Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS17P08708 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS17P08708 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS17P08708 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS17P08708 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS17P08708 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS17P08708 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS17P08708 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS17P08708 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS17P08708 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS17P08708 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS17P08708 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS17P08708 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms