Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTRP02766 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TTRP02766 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTRP02766 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTRP02766 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTRP02766 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTRP02766 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTRP02766 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTRP02766 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTRP02766 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTRP02766 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms