Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX11BO96011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms